scoup: Simulate Codon Sequences with Darwinian Selection Incorporated as an Ornstein-Uhlenbeck Process
Das R-Paket „scoup" ist ein neuartiger Codon-Sequenz-Simulator auf der Bioconductor-Plattform, der durch die Kombination des Halpern-Bruno-Mutations-Auswahlmodells mit einem Ornstein-Uhlenbeck-Prozess die Brücke zwischen Phylogenetik und Populationsgenetik schlägt, um komplexe evolutionäre Szenarien unter Berücksichtigung natürlicher Selektion zu simulieren.